Han jobbet i ulike stillinger i Mattilsynet i perioden 1995 til 2009, da han sluttet etter en konflikt. Siden da har han jobbet som selvstendig konsulent og bistått bedrifter i saker tilknyttet Mattilsynets ansvarsområde.

– Mattilsynet er ikke tilstrekkelig robust eller kompetent på forvaltningsjuridisk område, sier Nielsen til IntraFish.

– Ressursene en har utnyttes ikke til det beste for forvaltningen. Juristenes oppgave i offentlig forvaltning er primært å sikre at forvaltningen gjennomføres korrekt og at rettssikkerheten ivaretas, men i Mattilsynet brukes de i høyeste grad til å rydde opp etter saksbehandlingsfeil, og til å hindre at Mattilsynet / staten blir stilt til ansvar for feil, sier han.